野生鮭魚群需要冷、充分氧氣的水、乾淨的溪底和良好的魚覆蓋。在弗吉尼亞州，大多數鮭魚棲息地損失都是由於河流溫度增加，沉澱和溪流渠的改變而發生。
水溫要求可能是弗吉尼亞州鮭魚群所面臨的最關鍵因素，而該州的氣候一般溫暖和通常低的夏季流量並沒有幫助這種情況。夏季，大多數陰涼的山溪不超過 70° F，這適合鮭魚。即使在河畔植物保持完整的時候，也可以維持水生棲息地和適當的水溫。在大多數情況下，低 70 s 的最高溪流溫度在鮭魚的可容忍範圍內，但這種溫度改善了其他魚類的棲息地，但這種溫度可以改善了鮭魚無法與其他競爭的溪流魚的棲息地。
沉澱和其他更直接的棲息地改變形式，例如通道化，也使弗吉尼亞州花費了許多英里的鮭魚水。沉澱的溪底可減少河川的昆蟲群，這是一種魚類食物的重要來源。沉澱也使鮭魚生殖困難。鮭魚在溪谷碎石中產卵，清潔的碎石是必要的，以確保氧氣水在雞蛋上移動。只要四分之四英寸的泥漿在鮭魚卵上，就可能導致 100 百分之一的死亡率。
溪流道的改變也是關鍵的問題，不僅是由於它造成的沉澱增加，還是由於魚蓋的消除和水溫的可能會提高。鮭魚需要頂部遮蓋物，例如底下的堤岸、大岩石或浸水原木。當移除此類蓋子時，鮭魚會離開。缺乏適當的覆蓋範圍會限制溪流可以支撐的大型鮭魚數量。
由於棲息地衰退，弗吉尼亞州在 1970 中期之前失去了許多良好的野生鮭群。然而，導致這些損失的許多土地使用措施（廣泛的河流管道化、樹木技術不佳、清除河畔植物、沿岸地區的密集農業等）都已經改善，到過去幾十年來，實體棲息地一直在改善。此外，本署現時對野生鮭魚溪流進行清單，提供保護這個關鍵棲息地所需的數據。
該部門的鮭魚溪清查識別了弗吉尼亞州超過 2，350 英里的野生鮭溪流。鼓勵生物學家發現，弗吉尼亞州唯一原生的鮭魚種，河豚仍佔該州野生鮭資源的 80 百分比。西方介紹的彩虹鮭已經佔領了其他東南部州的許多本地河豚溪流。因此，弗吉尼亞州目前有比所有其他東南部州總共有更多本地的河豚溪流。
與鄰近州類似溪流的生長率相比，弗吉尼亞州的野生鯊魚，尤其是河豚的生長率非常出色。在大多數弗吉尼亞州溪流中，成年的河豚在第三年齡時，平均為 8-10 英寸。根據可用的溪流數量和現存的鮭魚的大小，弗吉尼亞州可能提供新英格蘭南部最好的本地河豚捕魚。
與溫水魚類不同，例如黃瓜和藍魚，鮭魚的繁殖能力非常低。因此，在嚴重捕獲的地區，必須保護鮭魚，直到它們能夠至少生產一次。為了實現這一目標，對弗吉尼亞州所有爬坡的鮭魚實施了 7 英寸的最低尺寸限制。這樣的限制將使大多數野生鮭魚在收穫之前達到產卵年齡。